猪系水力相关SNP检测及其与肉质性状关联分析开题报告

 2023-02-10 17:04:35

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

意义:系水力是最重要的肉品质指标之一,在养猪生产中提高猪肉系水力是改善猪肉品质、提高猪肉经济价值的重要途径[1]。本课题拟在先前snp芯片技术分析的猪全基因组变异位点中,筛选获得与肌肉系水力潜在相关的差异显著突变位点,通过扩大样本来进行进一步验证这些突变位点与猪肉系水力之间是否存在关联,为猪肉品质的提高提供理论基础。

国内外概况:研究表明,肌肉蛋白质净电荷含量、肌细胞的结构、肌细胞骨架构成、细胞膜、肌肉收缩以及遗传因素、环境因素等均对肌肉系水力有影响,其中肌肉品质遗传因素的研究主要集中在氟烷基因、酸肉基因等缺陷基因方面[2,3]。根据已有报道,猪肉系水力是一个遗传力中等偏低的性状,且由于该性状难以进行活体测定,因此采用表型测定和常规育种方法难以获得理想的遗传进展。采用分子标记辅助选择技术是改良猪肉系水力性状的有效方法,其前提是获得与目标性状相关的功能基因或分子遗传标记。然而,尽管系水力性状在养猪生产中具有重要的经济价值,但是对该性状产生的分子机制及相关遗传标记的研究却仍有待研究[3]

应用前景:该研究将为未来研究猪肉系水力遗传因素及其分子机制提供更加细致、科学的理论基础,为改善提高猪肉品质提供更加全面、高效的方式方法,其应用前景广阔。

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2. 研究的基本内容和问题

研究目标:从实验室先前snp芯片技术分析的猪全基因突变位点中,筛选与肌肉系水力潜在相关的候选位点,并研究其与猪肉系水力是否关联。

研究内容:本课题是在实验室之前研究工作的基础上,筛选获得与肌肉系水力潜在相关的突变位点,然后根据系水力高低进行等浓度混池,通过测序验证该snp是否存在于该群体中,再通过分型分析该位点不同基因型与系水力的关系。

拟解决的关键问题: 候选snp突变位点的筛选

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3. 研究的方法与方案

研究方法:该课题主要用到pcr技术、琼脂糖电泳检测技术、突变位点测序验证以及突变位点基因分型技术。

技术路线:

实验方案:

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4. 研究创新点

特色或创新之处

1、合理利用现有猪全基因snp芯片技术的分析结果,选择代表性突变位点分析其与猪肌肉系水力的关联。

2、利用基因测序、基因分型技术进行验证。

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5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

2015.8-2015.10

样品采集选择

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