长江刀鲚微卫星亲子鉴定技术研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1.课题意义：

亲子鉴定就是利用生物学、遗传学以及法医学的理论与技术，从子代和亲代的生理机能或形态构造等方面相似的特点，从而对遗传特征进行分析，判断父母与子女之间的亲缘关系。亲子鉴定在中国古代就已有历史，如早期的滴血验亲等。简单来说，亲子鉴定就是通过血型或dna测试等鉴定父母与子女之间的亲缘关系^[1]。

作为基因型的易于识别的表现形式，遗传标记在种质资源的研究和育种工作中有着十分重要的地位。而dna分子标记是直接在dna分子上检测生物间的差异，是在dna水平上遗传变异的直接反映^[2]。dna分子标记不受环境和发育阶段的影响，标记数丰富，可大大提高杂交育种的有效性和可靠性，而且在对杂种机理的认识、杂种优势的预测、目的性状的选择等方面已显示出不可比拟的优越性^[3]。而在目前对于水产动物的亲缘关系鉴定中，微卫星分子标记技术的应用较为广泛。ssr是根据微卫星重复序列两端的特定短序列设计引物，通过pcr反应扩增微卫星片段。因其核心序列的重复数目有所不同，所以可以扩增出不同长度的pcr产物，能更加有效的检测dna多态性^[4]。

2. 研究的基本内容和问题

1.研究目标及内容：

本实验以人工养殖的长江刀鲚作为研究对象，以3雌3雄共6条鱼作为亲本进行饲养，在其自由交配及繁殖情况下，共产生321条子代。本实验将通过对该批样本的亲本与子代的肌肉组织提取，进行dna的提取及检测，并进行微卫星标记及pcr扩增，最后对结果进行分析，从而验证亲本与子代的亲缘关系。

2.拟解决的问题：

3. 研究的方法与方案

样本由3雌3雄共6条亲本及其随机交配产生的子代组成。

1）dna提取

2）微卫星引物

4. 研究创新点

刀鲚应激反应强烈，很难一对一构建遗传家系，为得到有效地遗传家系，构建高密度遗传连锁图，本实验采用了多对亲本随即交配的繁殖方法，构建了一个混合群体，为做进一步分析，首次采用微卫星标记建立刀鲚的亲子鉴定技术体系。

5. 研究计划与进展

筛选一定数量的微卫星标记，明确其在刀鲚中的多态性，完成321尾个体的亲缘关系鉴定。

亲子鉴定的准确性依赖于标记的数量和标记的多态性，本研究是一个33群体，根据已有报道，2～3对标记一般可以精确鉴定，我们目前已经筛选了2对标记，如果准确性不足，可以后续继续筛选标记。