猪Barx2基因启动子区遗传变异位点检测及对重要经济性状的效应分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

一、本课题的意义

我国是猪肉生产和猪肉消费大国，猪肉是人们生活中动物性蛋白的主要来源，生猪养殖在我国畜牧业板块占据重要位置，而遗传改良对养猪生产的贡献率高达40%，表明其在养猪生产中起到了主要作用。生长速度是猪育种中选择的主要目标性状之一,鉴定影响猪生长速度的基因具有重要的实践意义和理论价值。研究发现，在纯合或杂合的barx2基因缺陷幼鼠身上都发现了生长速度减慢的现象，hp makarenkova等人得出结论:barx2基因缺陷小鼠体型较小是由肌肉生长速度减慢所导致。这表明barx2是一个重要的内源性调节因子，它在机体肌肉生长发育过程中发挥着重要的作用，但目前的研究主要集中在小鼠和人上，对猪barx2基因启动子区遗传变异位点的检测以及这些遗传变异位点对猪肉质性状的影响研究较少。因此，本研究拟定猪barx2基因作为影响猪肉质性状的重要候选基因，旨在利用目标区域靶向测序技术对barx2基因启动子区变异位点进行检测，并利用混合模型对变异位点多态性与重要经济性状进行关联分析，通过分析确定barx2基因启动子遗传变异位点与肉质性状的潜在关联。本实验通过对barx2基因启动子区遗传变异位点检测以及对重要经济性状的效应分析，探究barx2当中是否存在相应的遗传分子标记位点为猪重要经济性状的遗传改良供理论指导。

二、国内外研究概况

2. 研究的基本内容和问题

一、研究目标

（1）鉴定猪barx2基因启动子中的遗传变异位点；

（2）明确这些变异位点在不同猪种的遗传多样性进行分析

3. 研究的方法与方案

一、技术路线

①对279头皮×杜×长×大bf、imf、cw组织进行测量

②组织dna提取

4. 研究创新点

本研究的特色之处在于所拟定的候选基因是前期指导老师课题组通过高能量转录组测序技术所鉴定的影响猪肉色性状的差异表达基因，作为影响猪重要经济性状的立项依据充分。本研究采用高通量的目标区域靶向测序对Barx2基因启动子区域的变异位点进行全面鉴定，所采用的技术较先进。

5. 研究计划与进展

一、研究计划

2018年9月申请课题，咨询指导教师，确定课题研究方向，查文献，撰写文献综述。

2018年10月开始本课题实验，计划在2019年5月结束课题研究。