1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
猪轮状病毒病是由猪轮状病毒（porcine rotaviruses，prvs）引起的猪的急性肠道传染病[1-2]。
prvs 是引起仔猪腹泻的主要病原之一。
1~4 周龄仔猪的发病率超过 80%，死亡率为 7%~20%[3-5]。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标：利用轮状病毒基因组由11个rna片段组成的特点,进行病毒的基因测序，调查轮状病毒的流行情况,确定变异毒株的全长基因,为防预提供依据。
研究内容：参考文献根据prv具有11个rna片段设计引物。
对病料进行prv检测。
3. 研究的方法与方案
研究方法：参考文献根据prv11个rna片段设计引物。
对实验室的临床病料做prv检测，阳性病料扩增prv vp4片段、vp7片段基因，琼脂糖凝胶电泳，将目的条带亮的胶块切下送去测序公司测序，目的条带较暗的胶块做凝胶回收，把目的片段与t载体相连，然后转入dh5α，大量培养后提质粒，进行测序。
利用相关软件分析比对测序所得序列，并对有缺失、插入或改变序列的毒株进行全基因组测序技术路线：详情见附件实验方案：1.1 临床病料检测从江苏省，华东地区规模化猪场获取病料，对病料进行prv检测，获取阳性病料，并测得阳性率。
4. 研究创新点
运用RT-PCR技术，扩增合成目的片段，该技术用途广泛，可用于检测细胞中基因表达水平，细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列，后通过测定猪轮状病毒的全长基因序列来及时发现PRV流行毒株的变异情况，为该病的防控和疫苗候选株的筛选提供理论依据。
5. 研究计划与进展
研究计划：在整个实习过程中，分步进行基因测序，找出引物的最适温度，确定11个蛋白的基因片段大小，再进行拼接来确定轮状病毒的基因全长，时间充裕的话，能够另外测出其他几个阳性样品的部分基因序列。
预期进展：在实习期间能够完整的测出一株轮状病毒的基因全长序列.
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