1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
新生仔猪肠道本身是处于无菌状态的，仔猪通过与外界环境和母亲的产道、粪便接触［1］，造成需氧、兼性厌氧和专性厌氧菌在其肠道内按照一定次序定植［2］。
因为随着需氧菌和肠杆菌、肠球菌等兼性厌氧菌的定植，胃肠道的氧气被消耗完毕，继而逐渐形成厌氧环境，导致专性厌氧菌开始定植和生长。
有研究表明，仔猪不同胃肠道部分的微生物分布和组成有很大差异。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究目标通过在江苏省各地区猪场进行病料采集，获取大量的一线病料，并对其中主要的肠道微生物进行分离培养、进一步纯化，再进行血清学鉴定分型与pcr的基因型分型，获得猪肠道的主要致病性细菌，本实验拟获取的目的细菌为沙门氏菌，大肠杆菌，金黄色葡萄球菌，猪链球菌等。
在细菌学实验室分离主要肠道致病菌的同时，对沙门氏菌噬菌体进行分离纯化，并筛选噬菌斑找出噬菌体的宿主谱，为后续噬菌体功能分析、基因组分子水平操作及噬菌体治疗制剂的筛选做出充分的准备工作。
2.实验内容仔猪肛门拭子采样、细菌学的病原分离鉴定、沙门氏菌噬菌体的分离鉴定3.拟解决的关键问题江苏地区猪肠道致病性微生物的主要类型，及其中沙门氏菌噬菌体的宿主谱分布。
3. 研究的方法与方案
4.研究方法该课题将用到的研究方法有文献研究法和实验研究法，实验研究法又分别有细菌分离纯化技术,基因工程技术，PCR技术，噬菌体分离纯化技术，血清学分型技术。
5.技术路线及实验方案肛门拭子采样法及鼻部拭子采样法获取仔猪肠道呼吸道的主要病料细菌学分离纯化技术 噬菌体分离纯化技术细菌增菌液增菌培养 点滴法初步纯化噬菌体重复平板划线法获取纯化的单菌落重复双层平板法获取纯化的单个噬菌斑PCR技术对纯化的细菌进行基因型分型双层平板法测量噬菌体宿主谱血清学实验对沙门氏菌进行血清分型 改造噬菌体并测量改造后宿主谱变化6.可行性分析本课题所开展的前期工作较充分，课题组所在的OIE猪链球菌参考实验室和噬菌体研究平台有多年的细菌学和噬菌体方向的研究，具备研究相关内容所需的仪器设备及试剂，成功发表了数篇相关研究的SCI论文，课题组具备充分地查阅文献资料的条件，另外老师定期开展的课程、讲座也将为本课题的研究提供很多指导。
4. 研究创新点
7.创新之处仔猪肠道的细菌病迄今仍是当前养殖场危害严重的传染病，大肠杆菌引发的仔猪黄白痢和水肿病以及沙门氏菌引起的仔猪副伤寒每年对养猪业造成的损失巨大。
传统的抗生素疗法虽然对于细菌性疾病有较为显著的作用，但由于抗生素的过度使用造成的细菌耐药性不断增加以及抗生素对于肠道正常菌群的破坏使得人们开始寻求一种更易操作、副作用更小、更加有效且安全的细菌病疗法。
本课题从仔猪肠道主要致病性细菌的分离鉴定入手，探索噬菌体对于目的细菌一系列作用，期望能从一线养殖场收集大量病原资料的同时为噬菌体治疗制剂的研发提供基础的准备工作。
5. 研究计划与进展
8.研究计划及预期进展2017年7月18日-2017年8月23日暑期前往江苏大丰光明核心养殖场采取仔猪肛门拭子和鼻部拭子病料2017年10月7日-2017年11月16日 查阅文献资料，准备实验物品，学习主要的细菌病料分离方法2017年11月17日-2017年12月31日 病料的细菌的分离纯化，PCR基因学分型，血清学分型2018年3月7日-2018年4月20日 病料中噬菌体的分离纯化，测量噬菌体宿主谱分布，改造噬菌体后噬菌体新宿主谱的测定2018年4月21日-2018年5月10日 实验数据资料的整合，实验结果总结分析，撰写毕业论文
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