微卫星分型方法改进的研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1.本课题的意义：微卫星即ssr(simple sequence repeats), 是以少数几个(一般为1-6bp)核苷酸为重复单位的首尾串联重复dna序列,是真核生物基因组中重复序列的主要组成成分之一。

它具有等位基因变异多、信息含量高；稳定性好、 重复性好;种特异性强、进化所受选择性压力小；以孟德尔方式分离、呈共显性遗传；可利用pcr进行分析，操作简单等优点，因此被作为优良的分子遗传标记广泛应用。

微卫星分型是微卫星分析的关键步骤，分型方法是否简捷可靠至关重要。

2. 研究的基本内容和问题

1.研究目标对现有的荧光标记引物测序法进行改进，达到事半功倍的效果。

2.研究内容：微卫星分型采用荧光标记引物测序法，其原理是用带颜色的荧光染料标记微卫星引物的某一条，将带有荧光标记的pcr产物与hidi混合，通过毛细管电泳，利用abi genemapper4.0软件进行数据分析，从而得出目的微卫星片段长度。

本研究要求合理搭配不同颜色荧光染料和多对引物，利用多重pcr得到多个微卫星位点混合扩增产物。

3. 研究的方法与方案

1.研究方法及实验方案：(1)熟练掌握常规方法，本试验要求较高的试验操作精度；(2)初步尝试新方法，通过试验结果调整PCR体系和程序得出最优体系和程序；(3)本实验室可提供充足的截形叶螨实验材料，多个地理种群和多个叶螨个体试验验证该方法的可靠性；(4)实验结果与实验室之前截形叶螨微卫星开发的结果进行比较验证此方法的稳定性；2.可行性分析：本实验室具备了叶螨采集饲养、DNA提取及DNA保存条件，同时学院相关仪器试剂也可以满足实验的需要。

4. 研究创新点

本试验结合多重PCR对叶螨微卫星分型方法进行改进，减少了试剂浪费特别是高成本的荧光材料。

5. 研究计划与进展

1.研究进展：2013.05-2013.07常规方法进行微卫星分型及新方法尝试；2013.07-2013.08截型叶螨最优PCR体系和程序调试预实验；2013.08-2013.09截型叶螨2个种群试验；2013.10-2014.01数据分析及论文写作。

2.预期进展预期能够按照研究计划逐步完成实验。